ایجاد منطقه‌ی ویژه‌ی اقتصادی خراسان جنوبی در بیرجند، در برنامه‌ی چهارم توسعه مطرح و به تصویب هیئت  وزیران رسیده بود، تا این‌که در سال ۱۳۸۹ این طرح توسط مجلس شورای اسلامی تصویب و به تاًیید شورای نگهبان رسید. 
این منطقه در دو سایت مرکزی به مساحت ۷۳۰ هکتار و سایت مرزی به مساحت ۱۰۰ هکتار با کاربری صنعتی، تجاری و خدماتی کار خود را آغاز کرده است.
این منطقه به عنوان تنها منطقه‌ی ویژه‌ی اقتصادی کشور است که دارای یک قطعه‌ی منفصله در نقطه‌ی صفر مرزی مستقر در مرز رسمی ماهیرود (میل ۷۸) می‌باشد.
منطقه‌ی ویژه‌ی اقتصادی بیرجند در خراسان جنوبی یکی از بزرگ‌ترین مراکز مهم در حال توسعه‌ی شرق کشور است که به دلیل برخورداری از مزایای ویژه و موقعیت جغرافیایی، وسعت کافی و استعدادهای منحصربه‌فرد و قرار گرفتن در حلقه‌ی طلایی کریدور بین‌المللی ترانزیت شمال شرق – جنوب شرق، دسترسی به بازارهای بزرگ افغانستان و کشورهای آسیای میانه برخوردار است.